Под ферментацией понимают всю совокупность последовательных операций от внесения в заранее приготовленную и термостатированную среду инокулята до завершения процессов роста, биосинтеза или биотрансформации. Ферментация проходит в специальных емкостях, называемых ферментерами или биореакторами.